Sono stati originariamente concepiti come parte dell'alchimia o proto-scienza (pre-scienza), che in seguito si è evoluta in chimica. Fino al XVIII secolo, i suddetti simboli venivano usati per denotare determinati elementi e composti. I simboli variavano leggermente nei segni degli alchimisti, quindi quelli che conosciamo fino ad oggi sono il risultato della standardizzazione di questi segni.
Secondo Paracelso, questi segni sono conosciuti come i Primi Tre:
sale - che denota la base della sostanza - segnato sotto forma di un cerchio con un diametro orizzontale chiaramente segnato,
il mercurio, cioè il legame liquido tra alto e basso, è un cerchio con un semicerchio in alto e una croce in basso,
zolfo - lo spirito della vita - un triangolo collegato da una croce.
I seguenti sono i simboli per gli elementi della terra, tutti sotto forma di triangoli:
Metalli contrassegnati con simboli di pianeti e corpi celesti:
I simboli alchemici includono anche:
Ouroboros è un serpente che si mangia la coda; in alchimia simboleggia un processo metabolico in costante rinnovamento; è il gemello della pietra filosofale.
Eptagramma - significa i sette pianeti conosciuti dagli alchimisti nei tempi antichi; i loro simboli sono mostrati sopra.